Dalam melaksanakan tugas pokok dan fungsinya secara efektif dan efisien, UPT. Pengambangan Laboratroium dan teknologi Universitas Amikom Purwokerto memiliki struktur organisasi Berdasarkan ketersedian SDM yang ada saat ini di UPT Pengambangan Laboratorium dan teknologi mengacu kepada keahlian dan ketrampilan personal. Adapun divisi pada struktur organisisasi UPT.PLT sebagai berikut :

1. Kepala UPT.Pengembangan Laboratorium dan Teknologi
2. Divisi Pusat Data & PSI
3. Divisi Infrastruktur & Networking
4. Divisi Helpdesk & Dokumentasi
5. Divisi Konten & Multimedia